植物方面,調查發現共有維管植物424種,隸屬于114科303屬。其中蕨類植物9科11屬14種,裸子植物4科10屬11種,被子植物101科282屬399種。調查得出南山植物群落具有以下特征:以闊葉林為主,針葉樹種較少。針葉樹種主要為杉木,典型闊葉林樹種為樸樹、麻櫟等。南山調查共發現國家重點保護野生植物2種,分別為大葉櫸樹和野大豆,均為Ⅱ級保護野生植物。此外,還對南山的藥用植物進行了調查統計,目前南山共有菝葜、藿香、益母草、紫蘇、澤漆等藥用植物190種。